Ważne, by zdiagnozować boreliozę we wczesnej fazie, ponieważ można ją wówczas całkowicie wyleczyć. Natomiast zaawansowana choroba w stadium przewlekłym trudno poddaje się terapii i część dolegliwości pozostaje na całe życie.
Podstawą diagnostyki Borreliozy jest wykonanie badania specyficznych przeciwciał przeciwko Borrelia klasy IgG i IgM metodą ELISA jest zalecane przez Polskie Towarzystwo Epidemiologów i Lekarzy Chorób Zakaźnych jako pierwszy etap diagnostyki. Wynik dodani w teście ELISA w klasie IgG lub IgM należy potwierdzić dokładniejszym testem Western Blot.