Chromograninę A można traktować jako niespecyficzny marker nowotworowy, a monitorowanie jej stężenia pomaga w wykrywaniu i diagnozowaniu tego rodzaju guzów. Oznaczenie jej głównie wykorzystywane jest w diagnostyce rakowiaków- nowotworów neuroendokrynnych przewodu pokarmowego żołądkowo-jelitowo-trzustkowych ( GIST ) i płuc. Osoby z objawami takimi jak : napadowe zaczerwieniania skóry twarzy i szyi, skoki ciśnienia tętniczego, nadmierne pocenie, duszność, kaszel, nawracające wymioty i biegunki – wszystkie te symptomy pojawiające się epizodycznie mogą być podstawą do wykonania badania. Niski poziom chormograniny A i braków objawów nowotworów jest związany z niskim prawdopodobieństwem nowotworu. Wysoki poziom może świadczyć o chorobie nowotworowej bądź chorobach wątroby, przewlekłej chorobie nerek, cukrzycy, nadciśnieniu, przy zapaleniu trzustki a także w stresie.